內部審核是一項年度系統性的審核活動，是對全年管理體系運行情況的整體評估。通過內部審核，能不能反映真實情況，能不能發現和解決問題，對一個機構非常關鍵。在實施內部審核之前，做好充分的準備，將有效提升內部審核的效果。
（1）應明確審核的重點。內審組長應依據年初策劃的內審方案，明確內部審核的重點要素、重點部門、重點過程，強調所要解決的問題，為內審指明方向。
（2）應明確內審員分工，內審員的選擇和分工會直接影響內審效果，內審組長應依據此次內審的重點方向，選擇好具備相應專業的內審員，布置審核任務，明確內審的分工和職責。
（3）應商定具體的內審計劃。應根據機構的具體情況確定內審的時機，明確內審具體日程安排，內審計劃應充分考慮實驗室的實際，確保計劃編制合理。
（4）應編制好內審檢查表。內審員應根據分工和內部審核的重點，在內審前編制好內審檢查表，應明確審核的對象、審核重點、審核方法及審核結果，尤其審核方法應包括關注的問題及詳細抽樣的項目。
（5）應明確內審的要求。應保持內部審核的嚴肅性，維護內部審核秩序，審核應客觀、真實、不受干擾地實施內審，確保內審目標的實現。
