清倉消毒 將倉庫內垃圾以及化肥、農藥等清除，庫內鋪設油氈紙等作防潮層，以減少地面潮氣被種子吸收。用80%敵敵畏乳油稀釋后噴灑，門窗緊閉48～72小時后通風24小時。不要用煙熏倉。
合理堆放 花卉種子品種繁多，等級不一，但一般種子數量并不多。在倉庫中要放置在距離墻壁約50厘米，離地面有50厘米的架臺上，做好標牌，標明其位置、數量、包裝等，以防混雜。
適時通風 種子呼吸產生很大熱量，適時通風可降溫散濕。一般以“晴通雨閉雪不通，滴水成冰可以通，早開晚開午少開，夜有霧氣不能開”為原則。通風多采用自然通風，有條件的可用機械通風。
勤于檢查 倉庫就要及時檢查，在種子越夏或越冬后都要對種子的含水量和發芽率進行檢查。在倉庫不同部位多點設置溫、濕度測量計，定人定時測量，做好記錄。一定要保持花卉種子貯藏的低溫低濕環境，以防種子霉變或發芽率降低。
