中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所雞遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊圍繞雞異嗜性粒細(xì)胞與淋巴細(xì)胞比值（H/L）選擇系的抗菌機制開展了多組學(xué)聯(lián)合分析，在雞抗病力遺傳機理解析方面取得重要進(jìn)展，為我國地方雞種抗病力性能評估和功能基因的挖掘與應(yīng)用提供了重要參考。相關(guān)成果發(fā)表在《通訊生物學(xué)（Communications Biology）》、《農(nóng)業(yè)科學(xué)學(xué)報（Journal of Integrative Agriculture）》和《免疫學(xué)前沿（Frontiers in Immunology）》上。
據(jù)趙桂蘋研究員介紹，H/L比值和雞的抗病抗應(yīng)激能力負(fù)相關(guān)，團(tuán)隊前期以京星黃雞為素材，構(gòu)建了低H/L定向選育系，9個世代定向選擇后，群體H/L值由0.5降低至0.25，群體遺傳結(jié)構(gòu)有所分化。研究發(fā)現(xiàn)低H/L選育系具有更強的抗沙門氏菌能力，但H/L如何調(diào)控先天免疫水平的遺傳機制尚不明晰。通過構(gòu)建F2分離群體，結(jié)合GWAS分析，鑒定到 PTPRJ 基因與H/L比值相關(guān)，并證明rs73679947位點CC為優(yōu)勢基因型。該位點變異位于增強子區(qū)域，相關(guān)位點突變后，增強子作用減弱，導(dǎo)致 PTPRJ 基因表達(dá)下調(diào)。 PTPRJ 基因低表達(dá)抑制下游 LYN 、 SHP1 、 SHIP1 等基因表達(dá)，導(dǎo)致對異嗜性粒細(xì)胞功能的抑制作用減弱，從而提高機體抗沙門氏菌能力。
雞外周血巨噬細(xì)胞細(xì)胞是影響雞H/L比值重要因素，且其吞噬作用構(gòu)成了先天免疫的強大屏障。通過對不同雞種巨噬細(xì)胞細(xì)胞功能比較分析發(fā)現(xiàn)，大骨雞外周血巨噬細(xì)胞吞噬能力強于文昌雞，且二者巨噬細(xì)胞細(xì)胞的差異表達(dá)基因富集于沙門氏菌感染、吞噬體等免疫相關(guān)信號通路。WGCNA分析發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞代謝和氧化磷酸化信號通路與巨噬細(xì)胞吞噬作用相關(guān)。全基因組選擇性清除分析顯示，與巨噬細(xì)胞相關(guān)的 H2AFZ 等基因在兩品種中明顯分化。
該研究得到國家自然科學(xué)基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研項目、國家重點研發(fā)計劃、海南省崖州灣種子實驗室等項目資助。
原文鏈接：https://doi.org/10.1038/s42003-023-04559-x
https://www.researchgate.net/publication/359528152
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9941738/
日期：2023-03-06
據(jù)趙桂蘋研究員介紹，H/L比值和雞的抗病抗應(yīng)激能力負(fù)相關(guān)，團(tuán)隊前期以京星黃雞為素材，構(gòu)建了低H/L定向選育系，9個世代定向選擇后，群體H/L值由0.5降低至0.25，群體遺傳結(jié)構(gòu)有所分化。研究發(fā)現(xiàn)低H/L選育系具有更強的抗沙門氏菌能力，但H/L如何調(diào)控先天免疫水平的遺傳機制尚不明晰。通過構(gòu)建F2分離群體，結(jié)合GWAS分析，鑒定到 PTPRJ 基因與H/L比值相關(guān)，并證明rs73679947位點CC為優(yōu)勢基因型。該位點變異位于增強子區(qū)域，相關(guān)位點突變后，增強子作用減弱，導(dǎo)致 PTPRJ 基因表達(dá)下調(diào)。 PTPRJ 基因低表達(dá)抑制下游 LYN 、 SHP1 、 SHIP1 等基因表達(dá)，導(dǎo)致對異嗜性粒細(xì)胞功能的抑制作用減弱，從而提高機體抗沙門氏菌能力。
雞外周血巨噬細(xì)胞細(xì)胞是影響雞H/L比值重要因素，且其吞噬作用構(gòu)成了先天免疫的強大屏障。通過對不同雞種巨噬細(xì)胞細(xì)胞功能比較分析發(fā)現(xiàn)，大骨雞外周血巨噬細(xì)胞吞噬能力強于文昌雞，且二者巨噬細(xì)胞細(xì)胞的差異表達(dá)基因富集于沙門氏菌感染、吞噬體等免疫相關(guān)信號通路。WGCNA分析發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞代謝和氧化磷酸化信號通路與巨噬細(xì)胞吞噬作用相關(guān)。全基因組選擇性清除分析顯示，與巨噬細(xì)胞相關(guān)的 H2AFZ 等基因在兩品種中明顯分化。
該研究得到國家自然科學(xué)基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研項目、國家重點研發(fā)計劃、海南省崖州灣種子實驗室等項目資助。
原文鏈接：https://doi.org/10.1038/s42003-023-04559-x
https://www.researchgate.net/publication/359528152
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9941738/
日期：2023-03-06
