產(chǎn)品索引 | 5870 |
中文名稱: | plasmid DNA的抽提•純化試劑盒 |
英文名稱: | MagExtractor®-Plasmid- |
產(chǎn)品編號: | NPK - 300 |
產(chǎn)品類別: | 分子生物學(xué) |
生產(chǎn)廠家: | TOYOBO |
產(chǎn)品價(jià)格: | 300 |
產(chǎn)品規(guī)格: | 50次 |
MagExtractor
-Plasmid-
使用說明書
(Code No. : NPK - 301)
TOYOBO CO. , LTD. Biochemical Operation Department
OSAKA JAPAN
—目錄—
[1] 前言............................................................................................................................. 1
[2] 使用前須知................................................................................................................. 1
[3] 試劑盒中所包含的物品............................................................................................. 2
[4] 操作程序..................................................................................................................... 2
1.試劑盒以外所需要的其他物品.......................................................................... 2
(1)試劑............................................................................................................. 2
(2)器具·器材................................................................................................. 2
2.抽提流程.............................................................................................................. 3
3.宿主菌的培養(yǎng)...................................................................................................... 3
4.集菌...................................................................................................................... 4
5.試劑的制備.......................................................................................................... 5
6.用MFX-2000抽提DNA的方法....................................................................... 5
(1)操作程序的選擇......................................................................................... 5
(2)加溫block,回收block的溫度設(shè)定....................................................... 6
(3)附帶專用過濾器的tip頭設(shè)置................................................................... 6
(4)專用試管的設(shè)置......................................................................................... 7
(5)試劑的設(shè)置................................................................................................. 8
(6)樣品的前處理及其設(shè)置........................................................................... 10
(7)抽提開始................................................................................................... 11
(8)樣品的回收............................................................................................... 11
(9)根據(jù)操作手冊抽提plasmid DNA的方法............................................ 12
[5] 一般樣品的分析....................................................................................................... 13
(1)A260,A280及A320的測定......................................................................... 13
(2)電泳........................................................................................................... 13
(3)DNA測序................................................................................................. 13
[6] 疑難解答................................................................................................................... 14
1.使用MFX-2000的場合................................................................................... 14
2.手動操作的場合............................................................................................... 14
注意:
本試劑盒中所包含的試劑都是研究用試劑。請不要用于診斷,臨床等場合。在使用本試劑盒的時(shí)候,請嚴(yán)格遵守實(shí)驗(yàn)室的基本注意事項(xiàng),并注意安全。
[1] 前言
MagExtractor -Plasmid-利用在Chaotrpic(鹽)試劑存在的情況下,核酸能吸附在硅膠表面的特性,進(jìn)行plasmid DNA的抽提·純化。磁性體使用的是封入的磁珠,所以能夠利用永久磁石很容易地分離回收核酸。磁珠依據(jù)吸附條件,分別對蛋白質(zhì),DNA,RNA等不同物質(zhì)具有不同的吸附能力,所以能夠簡便地純化核酸。本試劑盒除了作為用于全自動核酸抽提裝置MFX-2000的試劑外,也可以作為手動抽提試劑盒來使用。
性能·特征
·能夠從大腸菌中抽提·純化出plasmid DNA
·能夠回收3~6μg的plasmid DNA(50~150ng/μl)*1,可用于轉(zhuǎn)化,限制酶處理,DNA 測序反應(yīng)等。
·能在10~15min之內(nèi)抽提出plasmid DNA。
·不使用苯酚、氯仿等危險(xiǎn)溶液。
·無需乙醇沉淀。
[2] 使用前須知
1)注意
MagExtractor -Plasmid-準(zhǔn)備了四種對應(yīng)于MFX-2000,二種對應(yīng)于手動的操作程序。使用對磁珠不進(jìn)行干燥處理的操作程序(手動操作程序Ⅰ以及MFX-2000的”Speedy”和”Lowcost”等操作程序)所得到的回收液,需要注意以下幾點(diǎn)。
·對于限制酶及轉(zhuǎn)化處理,可直接加以使用。
·瓊脂糖電泳時(shí)的Loading Dye必須使用本試劑盒附帶的產(chǎn)品。使
用一般的產(chǎn)品組分時(shí),可能樣品會無法沉淀。
·當(dāng)用于DNA測序時(shí)的模板時(shí),乙醇會阻礙測序反應(yīng),可將回收液置于1.5ml試管內(nèi),保持試管打開狀態(tài)加溫至78℃ 40min。(也可只加溫處理必要的劑量。參考13頁。)
·為了不讓乙醇混入回收液中,請使用手動操作程序Ⅱ(參
考12~13頁),如果是MFX-2000的場合下,請使用”Dryup”
或”Fullauto”等操作程序。
*1 從M109/pUC19過夜培養(yǎng)液中進(jìn)行抽提的場合。
[3] 試劑盒中所包含的物品
本試劑盒中含有能夠進(jìn)行500次plasmid DNA回收的試劑量。
130 x 2ml........ 吸附液(含有蛋白質(zhì)變性劑)............................................ 4℃或者室溫下保存
16ml........ 磁珠Ⅰ............................................................................. 4℃或者室溫下保存
16ml........ 磁珠Ⅱ............................................................................. 4℃或者室溫下保存
80ml........ 再懸浮液....................................................................................... 4℃下保存
80ml........ 溶解液Ⅰ(含有蛋白質(zhì)變性劑)........................................ 4℃或者室溫下保存
20ml........ 溶解液Ⅱ(含有蛋白質(zhì)變性劑)...................................................... 4℃下保存
65ml........ 中和液............................................................................. 4℃或者室溫下保存
60ml........ 溶出液.......................................................................................... 4℃下保存
11ml........ 5 x Loading Dye........................................................................... 4℃下保存
·試劑如果沾在手或衣服上或使用后,請徹底用清水清洗。萬一不慎進(jìn)入眼睛,立刻
用清水徹底清洗,然后去看醫(yī)生。
·溶解液Ⅰ有時(shí)會產(chǎn)生析出物。請?jiān)谑覝亍?0℃下完全溶解后再使用。
·溶解液Ⅰ,Ⅱ的混合液在室溫下保存超過三個(gè)星期后請不要再使用。*1溶解液Ⅰ,Ⅱ以外的試
劑請?jiān)?℃下保存。
·使用本公司的核酸自動抽提裝置MFX-2000的情況下,請?jiān)谥付ǖ钠恐凶⑷氡匾膭┝浚糜谥付ú课弧T敿?xì)方法請參考MFX-2000的使用說明書。
[4] 操作程序
1.試劑盒以外所需要的其他物品
(1)試劑
·滅菌水(蒸餾水或者milliQ水經(jīng)過高溫高壓濕熱滅菌)
·乙醇溶液(99.5%以上的特級品,使用手動法的時(shí)候用70%
的乙醇溶液)
(2)器具·器材
·微量移液器
·微量移液器用的tip頭
使用MFX-2000的場合,必須配備以下物品。
·抽提專用試管(Code No:MFX-301)
·抽提專用6連試管(Code No:MFX-302)
·附帶專用過濾器的tip頭(Code No:MFX-402)
*1 有時(shí)plasmid DNA的回收量及純度會發(fā)生降低。
·試劑設(shè)置用試管(50ml用,15ml用,2ml用*1)
使用手動法的場合,必須配備以下物品
·1.5ml小型試管用的磁性臺架(商店有售)
·漩渦混合器或者小型試管混合器
·簡易臺式離心機(jī)(12,000r.p.m.)
2.抽提流程
MagExtractor -Plasmid-通過以下五個(gè)工序?qū)lasmid DNA進(jìn)行抽提和純化。
①集菌
②堿溶菌
③中和
④通過磁珠Ⅰ去除菌體殘?jiān)?br>⑤通過磁珠Ⅱ分解,純化Plasmid DNA
使用MagExtractor -Plasmid-和MFX-2000時(shí),上述的②~⑤可成為自動化操作。
3.宿主菌的培養(yǎng)
培養(yǎng)含Plasmid DNA的大腸桿菌。培養(yǎng)基可使用和通過LB,TB等堿性SDS法等方法來抽提Plasmid DNA的時(shí)候同樣的培養(yǎng)基。由于Plasmid的回收量受拷貝數(shù)量以及菌體數(shù)量影響,推薦使用使MagExtractor -Plasmid-能夠使回收量更加穩(wěn)定的MMI培養(yǎng)基。使用MMI培養(yǎng)基的情況下,菌體量和TB的情況等同(JM109 / pUC18,50μg / ml氨芐青霉素9~11O.D.)。
MMI培養(yǎng)基的配制方法
|←蒸餾水800ml
|←13g Bacto trypton
|←25g Bacto yeast extract
|←8.5g NaCl
|←4ml 丙三醇
|←20ml 1M Tris-HCI,pH7.2
| 加蒸餾水到1000ml
| 高溫高壓濕熱滅菌
*1 50ml,15ml試管請使用BECTON DICKINSON公司生產(chǎn)的BLUE MAX
2170,BLUE MAX 2196,2m試管請使用本公司生產(chǎn)的NO.72.693。
4.集菌
使用MagExtractor -Plasmid-能夠處理的菌體量在手動法時(shí)是12~13O.D.,使用MFX-2000時(shí)是5~9 O.D.。根據(jù)菌體量和抽提方法的不同所引起的回收量的不同可以參考下圖所示。在使用MFX-2000處理10 O.D.以上的劑量時(shí),有可能會無法進(jìn)行充分的攪拌(pipetting),使得純度下降,請務(wù)必注意。使用angle rotor對1.5ml試管進(jìn)行集菌時(shí),菌體量請按照圖2所示為標(biāo)準(zhǔn)。
·請將培養(yǎng)液置于1.5ml試管中。
·請用12,000rpm離心分離2min。
·請仔細(xì)去除上清部分。
|
|
手動法 |
MFX-2000 |
圖1:菌體量的不同引起的回收量的變化(JM109 / pUC18,MMI培養(yǎng)液)
過少 適量 過多
圖2:菌體量的標(biāo)準(zhǔn)
5.試劑的制備
·溶解液
請按照4:1(v:v)的比例對試劑盒中的溶解液Ⅰ*1,Ⅱ進(jìn)行混合。請將此混合液在室溫下保存,三周后請勿繼續(xù)使用*2。通過手動法抽提的時(shí)候需要150μg / 樣品。使用MFX-2000的時(shí)候,請參考第九頁的表【各試劑的使用劑量標(biāo)準(zhǔn)】進(jìn)行制備。
·70%乙醇溶液
只有在使用手動法的時(shí)候使用。需要1500μg / 樣品。
6.使用MFX-2000抽提Plasmid DNA的方法
在使用MFX-2000前,請務(wù)必閱讀MFX-2000的使用說明書。使用抽提程序中的”Dryup”或”Fullauto”程序時(shí),需要有加溫的功能*3。請使用標(biāo)準(zhǔn)式樣(加溫,簡易保溫功能 / Code No.:MFX-102)或者是特殊式樣(加溫,電子冷卻功能 / Code No:MFX-103)。
(1)操作程序的選擇
MFX-2000中準(zhǔn)備了4種可供抽提Plasmid DNA用的操作程序。選擇其中一個(gè),將其號碼輸入在液晶畫面中。
·一次操作只能選擇其中一個(gè)操作程序。
·下表的抽提時(shí)間不包含分裝時(shí)間。實(shí)際的抽提時(shí)間根據(jù)樣品不同
會有所變化,以下表的抽提時(shí)間 x 樣品數(shù) x 1.25(小時(shí))為標(biāo)準(zhǔn)。
號碼 | 液晶畫面的第3行顯示的內(nèi)容 | 樣品 | 抽提 時(shí)間 | 用途*1 | |
A | B | ||||
31 | [Plasmid: Speedy] | 再次懸濁液 | 10min | ○ | ∆*2 |
32 | [Plasmid: Dryup] | 再次懸濁液 | 15min | ○ | ○ |
33 | [Plasmid: Fullauto] | 集菌后的菌體 | 16min | ○ | ○ |
34 | [Plasmid: Lowcost] | 菌體抽提液 | 6min | ○ | ∆ |
*1 用途A:用于限制酶處理,轉(zhuǎn)化
用途B:DNA 測序,或使用回收液超過50%時(shí)的反應(yīng)。
*2 通過手動法進(jìn)行去除乙醇的操作后便可以進(jìn)行DNA 測序。
*1 有析出物的場合,請?jiān)谑覝亍?0℃中徹底溶解。
*2 Plasmid DNA的回收量和純度有時(shí)會降低。
*3 如果只使用”Dryup”或”Fullauto”操作程序,請使用基本樣式的
MFX-2000(簡易保溫功能 / Code:MFX-101)。
·操作程序 “31:Speed”
適用于限制酶處理以及轉(zhuǎn)化用Plasmid DNA的制備。將再次懸濁液置于MFX-2000中,大約在10min / 樣品下抽提出Plasmid。
·操作程序 “32:Dryup” “33:Fullauto”
適用于DNA 測序用Plasmid DNA的制備。處理較多菌體(7~9O.D.)時(shí)適合使用針對再次懸濁液的 “32:Dryup”,處理較少菌
時(shí)(5~6O.D.)時(shí)適合使用針對集菌后的菌體的“33:Fullauto”。
·操作程序 “34:Lowcost”
使用通過以下的操作設(shè)置處理過的樣品。由于僅使用專用試管1個(gè)/樣品(其他操作程序時(shí)3~4個(gè)),故能夠以較低成本回收Plasmid DNA,
并能夠在6min / 樣品下實(shí)現(xiàn)限制酶處理,以及轉(zhuǎn)化用的Plasmid DNA的制備。
集菌后的菌體
|←150μl再次懸浮液
| 用漩渦混合器攪拌60sec
|←150μl溶解液(溶解液Ⅰ,Ⅱ按4:1(v:v)的比例混合后的溶液)
| 反復(fù)顛倒試管5次以實(shí)現(xiàn)攪拌
| 放置于冰上5min
|←120μl中和液
| 反復(fù)顛倒試管5次以實(shí)現(xiàn)攪拌
| 放置于冰上5min
| 12,000rpm,10min
設(shè)定MFX-2000
(2)加溫block,回收block的溫度設(shè)定*1
| 加溫block | 冷卻block |
溫度設(shè)定 | 78℃ | 10℃ |
(3)附帶專用過濾器的tip頭設(shè)置
·請使用附帶專用過濾器的tip頭(Code No:MFX-402)
·tip已通過γ射線滅菌。戴上手套將需要量專用tip安裝在tip架中。
·關(guān)于tip的安裝位置請閱讀MFX-2000的使用說明書。
*1 設(shè)定方法請閱讀MFX-2000的使用說明書。
·將需要量專用tip安裝在tip架中。
| tip數(shù) | | tip數(shù) | ||||||||
操作程序號 | 31 | 32 | 33 | 34 | 操作程序號 | 31 | 32 | 33 | 34 | ||
樣品數(shù) | 1 | 10 | 11 | 11 | 5 | 樣品數(shù) | 13 | 61 | 74 | 74 | 26 |
2 | 13 | 15 | 15 | 6 | 14 | 64 | 78 | 78 | 27 | ||
3 | 16 | 19 | 19 | 7 | 15 | 67 | 82 | 82 | 28 | ||
4 | 19 | 23 | 23 | 8 | 16 | 70 | 86 | 86 | 29 | ||
5 | 27 | 32 | 32 | 12 | 17 | 78 | 95 | 95 | 33 | ||
6 | 30 | 36 | 36 | 13 | 18 | 81 | 99 | 99 | 34 | ||
7 | 33 | 40 | 40 | 14 | 19 | 84 | 103 | 103 | 35 | ||
8 | 36 | 44 | 44 | 15 | 20 | 87 | 107 | 107 | 36 | ||
9 | 44 | 53 | 53 | 19 | 21 | 95 | 116 | 116 | 40 | ||
10 | 47 | 57 | 57 | 20 | 22 | 98 | 120 | 120 | 41 | ||
11 | 50 | 61 | 61 | 21 | 23 | 101 | 124 | 124 | 42 | ||
12 | 53 | 65 | 65 | 22 | 24 | 104 | 128 | 128 | 43 |
(4)專用試管的設(shè)置
·請將專用試管設(shè)置在抽提架中。擺放位置根據(jù)操作程序的不同
而有所差異,請按照下表放置試管。
操作程序號 | 擺放場所 |
31~33 | A. B. C. D. E. F |
34 | A. B. C. D |
·請對加溫block(只限于操作程序32,33),回收block設(shè)置所需樣品數(shù)。
·對抽提架的A~F以及加溫block,請勿使用專用試管以外的其他
試管。否則有可能會產(chǎn)生故障。
·對于回收block,請使用Assist公司的No.72.730試管。*1
*1 對于回收block,除了MFX-2000專用試管外,帶螺旋式蓋的1.5ml試管Assist試管No.72.692等也能使用。由于回收液中會有不同程度的磁珠殘留,回收液超過50%的場合下,請對這些試管進(jìn)行12,000rpm×2min的離心操作(如果回收液在反應(yīng)液中的比例小于50%則不會存在問題。)
(5)試劑的設(shè)置
·本試劑盒內(nèi)不含有滅菌水和乙醇溶液(99.5%以上的特級品),請
自己準(zhǔn)備。
·請準(zhǔn)備50ml容量試管FALCON 2170,15ml容量試管FALCON
2196,2ml容量試管Assist試管No.72.694。*1
·根據(jù)樣品數(shù)的不同所需的試劑量也會不同。請根據(jù)第九頁的表,在
指定試管內(nèi)注入所需試劑的必要?jiǎng)┝俊?br>·注入試劑時(shí)請以試管上的刻度為標(biāo)準(zhǔn)。
·視操作程序,有可能不需要安裝某些試劑。
·將各試管放置在試劑架中。請將磁珠Ⅰ,Ⅱ再次搖勻,放置
在試劑架處。磁珠設(shè)置好后,請立刻啟動裝置(10分鐘以內(nèi))。
(否則將產(chǎn)生回收量參差不齊及操作故障。)
·抽提后剩下的試劑可以再次使用(可追加減去的量并設(shè)置在MFX-2000上)。如果不再接下去使用,請將蓋子蓋好保存。如果長時(shí)間處于蓋子打開狀態(tài),液體的組成成分有可能會起變化。
·使用的劑量請不要超過第九頁表中記載的規(guī)定劑量。這是造成試管
塞污染以及液體溢出的原因。
*1 使用其他物品會造成儀器運(yùn)作不穩(wěn)定。
【樣品數(shù)在1~12時(shí)的試劑使用劑量】
試劑名 | 試管容量 | 分裝量(ml) | 設(shè)置 位置 | |||
操作程序號 | ||||||
31 | 32 | 33 | 34 | |||
吸附液 | 50ml | 25 | 25 | 25 | 25 | 1 |
滅菌水 | 50ml | 25 | 25 | 25 | 25 | 2 |
乙醇溶液 | 50ml | 25 | 25 | 25 | 25 | 6 |
磁珠Ⅰ | 2ml | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 不要 | 7 |
磁珠Ⅱ | 2ml | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 8 |
再次懸濁液 | 15ml | 不要 | 不要 | 5 | 不要 | 9 |
溶解液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 不要 | 10 |
中和液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 不要 | 11 |
溶出液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 5 | 12 |
【樣品數(shù)在13~24時(shí)的試劑使用劑量】
試劑名 | 試管 容量 | 分裝量(ml) | 設(shè)置 位置 | |||
操作程序號 | ||||||
31 | 32 | 33 | 34 | |||
吸附液 | 50ml | 25 | 25 | 25 | 25 | 1 |
滅菌水 | 50ml | 25 | 25 | 25 | 25 | 2 |
乙醇溶液 | 50ml | 50 | 50 | 50 | 50 | 6 |
磁珠Ⅰ | 2ml | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 不要 | 7 |
磁珠Ⅱ | 2ml | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 1.5 | 8 |
再次懸濁液 | 15ml | 不要 | 不要 | 5 | 不要 | 9 |
溶解液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 不要 | 10 |
中和液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 不要 | 11 |
溶出液 | 15ml | 5 | 5 | 5 | 5 | 12 |
(6)樣品的前處理及其設(shè)置
根據(jù)操作程序需要對以下樣品進(jìn)行前期處理。
①使用程序31,32時(shí)
集菌后的菌體
|←150μl再次懸濁液
| 用漩渦混合器攪拌60sec
置于樣品孔
②使用程序33時(shí)
·把集菌后的菌體原樣放入樣品孔。
③使用程序34時(shí)
集菌后的菌體
|←150μl再次懸濁液
| 用漩渦混合器攪拌60sec
|←150μl溶解液(溶解液Ⅰ,Ⅱ按4:1(v:v)比例混合后的溶液)
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
| 放置于冰上5min
|←120μl中和液
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
| 放置于冰上5min
| 12,000rpm,10min
置于樣品孔*1
·將樣品放入樣品孔時(shí),請保持試管蓋開啟狀態(tài)(1~24號樣品的樣
品孔上印有號碼)。
·樣品試管使用通常的1.5ml試管時(shí),請先用剪子如下圖所示進(jìn)行剪斷后再使用。剪斷的時(shí)候請務(wù)必注意安全。
請?jiān)诖颂幖魯?br>
*1 菌體殘?jiān)粼谠嚬鼙谏蠒r(shí),試管仍然可以繼續(xù)使用。由于rotor有時(shí)會使得菌體殘?jiān)粼谠嚬艿撞浚哉垖⑸锨逡褐糜谄渌嚬芎笤龠M(jìn)行使用。
(7)抽提開始
·請確認(rèn)樣品,試劑試管(試劑量),試管種類,專用tip等是否已
按說明書所示安裝完畢。
·抽提之前,請先將tip廢棄盒清空。
·確認(rèn)各臺架的安裝位置(鎖定),確認(rèn)操作臺是否已完全收納到里
面,并將前門關(guān)閉。
·在液晶畫面上輸入操作程序的號碼以及樣品數(shù)。
·確認(rèn)顯示有“請按下開始鍵”的畫面內(nèi)容后,按下“START”
按鍵。
·抽提操作開始時(shí),液晶畫面會顯示“操作中”字樣。
·手伸進(jìn)驅(qū)動部位會有危險(xiǎn),因此操作中請務(wù)必關(guān)好前門,不要開啟。
(8)樣品回收
·所有抽提操作結(jié)束后,會再次顯示“請按下開始鍵”字樣的畫面。
·抽提的DNA被回收block上的試管回收。確認(rèn)裝置完全停止運(yùn)行
后,從回收block塊上取出試管,將其在低溫(4~10℃)下保存,直至使用為止。
·如果回收液中混入少量的磁珠,仍可以直接使用。
·從加溫block上取出試管時(shí),請確認(rèn)加溫block的開關(guān)是否已關(guān)閉并且溫度已下降至40℃以下。如果在加溫block尚熱的時(shí)候去取試管,有可能發(fā)生燙傷。
(9)通過手動法抽提plasmid DNA的方法
①操作程序Ⅰ(限制酶處理,轉(zhuǎn)化等級)
集菌后的菌體
|←150μl再次懸濁液
| 用漩渦混合器攪拌60sec
|←150μl溶解液(溶解液Ⅰ,Ⅱ按4:1(v:v)比例混合后的溶液)
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
| 放置于冰上5min
|←120μl中和液
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
| 放置于冰上5min
| 12,000rpm,5min
| 將上清液放入新的1.5ml試管中
|←500μl吸附液
|←30μl磁珠Ⅱ(反復(fù)顛倒攪拌,使其均勻混合)
| 攪拌60sec *1
| B/F分離 *2
|←720μl70%乙醇溶液
| 攪拌30sec 重復(fù)兩次
| B/F分離
|←50μl溶出液
| 攪拌60sec
| 12,000rpm,5min
| B/F分離
上清液
②操作程序Ⅱ(DNA 測序等級)
集菌后的菌體
|←150μl再次懸濁液
| 用漩渦混合器攪拌60sec
|←150μl溶解液(溶解液Ⅰ,Ⅱ按4:1(v:v)比例混合后的溶液)
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
| 放置于冰上5min
|←120μl中和液
| 反復(fù)顛倒試管5次以攪拌
*1 將攪拌強(qiáng)度設(shè)為最大,在室溫下用漩渦混合器或試管混合器進(jìn)行攪
拌。
*2 將試管置于磁性臺架上,磁珠靠近磁石,多次顛倒混合,使得蓋子
上的磁珠完全貼近磁石。然后,輕輕震動磁性臺架,使得粘在蓋子上
的溶液摔落下來。用微量移液器吸棄上清部分。
| 放置于冰上5min
| 12,000rpm,5min
| 將上清液放入新的1.5ml試管中
|←500μl吸附液
|←30μl磁珠Ⅱ(反復(fù)顛倒攪拌,使其均勻混合)
| 攪拌60sec
| B/F分離
|←720μl70%乙醇溶液
| 攪拌30sec 重復(fù)兩次
| B/F分離
|←500μl乙醇溶液
| 攪拌30sec
| B/F分離
| 78℃,15min(使磁珠干燥)
|←50μl溶出液
| 攪拌60sec
| 12,000rpm,5min
| B/F分離
上清液
[5] 一般樣品的分析
(1)A260,A280,A320的測定
·請將回收液瞬時(shí)高速離心后進(jìn)行測定。
·請用TE緩沖液的10~30倍稀釋后進(jìn)行測定。
(2)電泳
·5x Loading Dye:樣品:電泳緩沖液=按2:3:5~2:7:1比
例稀釋。
(3)DNA 測序
·按照操作程序32,33抽提出的DNA以及按照手動操作程序Ⅱ抽提出的DNA,請使用5~10μl用于反應(yīng)。
·按照操作程序31,34抽提出的DNA以及按照手動操作程序Ⅰ抽提出的DNA,其中混有10%濃度的乙醇溶液,會阻礙測序反應(yīng),請先去除乙醇。
·將樣品15μl注入到0.5ml試管內(nèi)。
·以78℃的溫度加溫直至液體蒸發(fā)完(約15min),然后用此試管混
合反應(yīng)液。
[6] 疑難解答
1.使用MFX-2000的場合
(1)plasmid DNA的回收量少,純度差
原因 | 對策 |
試劑量不足 | 在C, D, E孔中B/F分離后會分別剩下800μl,720μl及720μl 左右的試劑。如果此溶液量過少的話,則原因是使用的試劑量不足。請加液到規(guī)定劑量。如果回收液過少或者沒有,有可能是沒有安裝溶出液或溶出液少的緣故。 |
樣品量過多 | A, B孔的抽提試管中剩有50μl以上的液體時(shí),可能是因?yàn)榫w量過多,無法用專用tip吸走。請使用9 O.D.以下的菌體。 |
(1) plasmid DNA的回收量少
原因 | 對策 |
磁珠Ⅱ的使用量過少 | 請使用磁珠Ⅱ的規(guī)定劑量。 |
吸附液的使用量過少 | 請使用吸附液的規(guī)定劑量。 |
用70%以下濃度的乙醇溶液清洗磁珠,或者清洗時(shí)間過長 | 請用70%乙醇溶液洗凈。清洗請不要超過1min。 |
溶出液過少 | 請使用50μl以上的溶出液。 |
Plasmid DNA的拷貝數(shù)過少 | 使用手動法的情況下,請?jiān)黾映樘嵋?guī)模。菌體量,試劑的使用量可以增加至2倍。不過溶出液也會因此而增加,故回收濃度不會上升。 |
(2)Plasmid DNA純度差
原因 | 對策 |
菌體的溶解,殘?jiān)哪酃ば虿荒苷_M(jìn)行 | 請使用規(guī)定的溶解工序時(shí)間及溶解液劑量。此工序下的純度如果偏低,吸附·洗凈時(shí)的磁珠就會難以分散,回收液的純度也會因此變差。 |
用70%以上濃度的乙醇溶液來清洗磁珠,或者洗凈時(shí)間過短。 | 請用70%乙醇溶液清洗,直至磁珠完全分散(1min)。 |