中國科學院東北地理與農業生態研究所研究員馮獻忠課題組等選擇1份東北野生大豆、7份我國代表性栽培種，結合平均50×的三代測序和Hi-C測序，組裝了高質量大豆參考基因組。組裝的8個大豆基因組大小范圍為986.1-1001.3Mb，Contig N50=1.4-6.1Mb，BUSCO完整性評估為96.7%-97.3%；結合同源注釋、從頭注釋、轉錄組輔助注釋，在8個大豆中注釋得到57286-58392個基因。
基于8個高質量的大豆基因組，研究團隊鑒定到186-427萬個SNP，44-92萬個InDel，11750-25330個大的InDel，706-3006個易位事件，200-413個倒位事件。在野生大豆中鑒定到60個栽培大豆中缺失或變短的基因，以及野生大豆種質缺失或變短卻在栽培中存在的185個基因。
相關研究成果以Eight soybean reference genome resources from varying latitudes and agronomic traits為題，發表在Scientific Data上。該研究為大豆結構變異與遺傳育種研究提供了新的參考基因組。研究工作得到國家重點研發計劃、中科院重點研究項目、山東省“泰山學者”項目等的資助。
圖1.8個測序大豆品種
圖2.8個測序大豆品種基因組差異比較
日期：2021-07-14
基于8個高質量的大豆基因組，研究團隊鑒定到186-427萬個SNP，44-92萬個InDel，11750-25330個大的InDel，706-3006個易位事件，200-413個倒位事件。在野生大豆中鑒定到60個栽培大豆中缺失或變短的基因，以及野生大豆種質缺失或變短卻在栽培中存在的185個基因。
相關研究成果以Eight soybean reference genome resources from varying latitudes and agronomic traits為題，發表在Scientific Data上。該研究為大豆結構變異與遺傳育種研究提供了新的參考基因組。研究工作得到國家重點研發計劃、中科院重點研究項目、山東省“泰山學者”項目等的資助。
圖1.8個測序大豆品種
圖2.8個測序大豆品種基因組差異比較
日期：2021-07-14
