果樹所專家研究揭示非編碼RNA在蘋果不同組織中的表達特性

近日，中國農業科學院果樹研究所蘋果資源與育種創新團隊蘋果資源課題組研究揭示非編碼RNA在蘋果根系、韌皮部、葉片、花和果實中的表達特性，揭示通過結合mdm-miR482可在蘋果不同組織中具抗逆作用的多個lncRNA和circRNA，發現circRNA: Chr00:18744403|18744580通過與mdm-miR16相互作用可參與花器官的形態建成和著色；lncRNA：MSTRG.60895.2可作為mdm-miR393的模擬靶標調控MD17G1009000的表達，它可能在蘋果果實的花青素代謝中具重要作用。相關成果發表在《基因（Genes）》和《國際分子科學（International Journal of Molecular Sciences）》上。
 
　　非編碼RNA作為近年來的研究熱點，可直接調控mRNA的表達，亦可通過結合miRNA進而調控mRNA的表達，在植物的形態建成、生物和非生物逆境中具重要的調控作用。
 
　　該研究從蘋果5個主要組織中鑒定得到6495個circRNA和9440個lncRNA，獲得不同組織中特異表達的lncRNA和circRNA，通過功能預測，miRNA靶位點預測等手段，獲得特異表達lncRNA和circRNA在組織的特異表達特性和功能，以上結果為非編碼RNA在蘋果不同組織的功能解析奠定了基礎。
 
　　原文標題：expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA



日期：2022-05-30