鱘魚金色卵魚子醬非常稀有，相較于其他顏色魚子醬經濟價值更高，因此，對影響鱘魚卵顏色性狀潛在基因的探尋并提升育種效益是我院水產所胡紅霞研究員團隊承擔的鱘魚種業聯合攻關項目主要研究內容之一。目前鱘魚卵顏色變異的遺傳基礎尚未見報道。
北京市農林科學院水產所作為農業農村部鱘魚遺傳育種企業牽頭重點實驗室合作申報單位，與牽頭單位千島湖鱘龍科技有限公司合作，收集到62個金色卵（G）和黑色卵（B）俄羅斯鱘個體，進行了全基因組重測序分析研究。顯著富集的GO和KEGG通路與色素沉著（如蛋白質消化和吸收以及視黃醇代謝等）和免疫（如嘌呤代謝、噬菌體和霍亂弧菌感染）有關。12個基因（ACTA1、ADCY3、ADCY5、ATP6V1C1、ATP6V1H、CHST11、COL6A3、GART、KCNJ13、RDH10、KCNN4和XDH）被鑒定為可能影響鱘魚卵顏色的候選基因。此外，應用FST和XPEHH方法同時鑒定的四個基因（ATP6V1H、GART、RDH10和KCNN4）開發了四個KASP標記，在其他28個俄羅斯鱘個體（13個金色和15個黑色）中成功驗證，達到極顯著水平（P值<0.01）。由兩個正選擇SNP構建的單倍型對金色卵的預測準確率達到92.86%。
這項研究為揭示鱘魚卵顏色的分子機制奠定了基礎，并為金色卵鱘魚的選育提供了可靠的分子工具。相關內容“Whole-genome resequencing of Russian sturgeon （Acipenser gueldenstaedtii） reveals selection signatures associated with caviar color”發表在水產領域專業刊物Aquaculture 582 （2024） 740545。水產所胡紅霞研究員團隊宋海亮博士為第一作者，胡紅霞研究員與合作單位許式見高級工程師為共同通訊作者。
日期：2024-01-18
北京市農林科學院水產所作為農業農村部鱘魚遺傳育種企業牽頭重點實驗室合作申報單位，與牽頭單位千島湖鱘龍科技有限公司合作，收集到62個金色卵（G）和黑色卵（B）俄羅斯鱘個體，進行了全基因組重測序分析研究。顯著富集的GO和KEGG通路與色素沉著（如蛋白質消化和吸收以及視黃醇代謝等）和免疫（如嘌呤代謝、噬菌體和霍亂弧菌感染）有關。12個基因（ACTA1、ADCY3、ADCY5、ATP6V1C1、ATP6V1H、CHST11、COL6A3、GART、KCNJ13、RDH10、KCNN4和XDH）被鑒定為可能影響鱘魚卵顏色的候選基因。此外，應用FST和XPEHH方法同時鑒定的四個基因（ATP6V1H、GART、RDH10和KCNN4）開發了四個KASP標記，在其他28個俄羅斯鱘個體（13個金色和15個黑色）中成功驗證，達到極顯著水平（P值<0.01）。由兩個正選擇SNP構建的單倍型對金色卵的預測準確率達到92.86%。
這項研究為揭示鱘魚卵顏色的分子機制奠定了基礎，并為金色卵鱘魚的選育提供了可靠的分子工具。相關內容“Whole-genome resequencing of Russian sturgeon （Acipenser gueldenstaedtii） reveals selection signatures associated with caviar color”發表在水產領域專業刊物Aquaculture 582 （2024） 740545。水產所胡紅霞研究員團隊宋海亮博士為第一作者，胡紅霞研究員與合作單位許式見高級工程師為共同通訊作者。
日期：2024-01-18
