近日，林學院魏安智教授團隊在園藝頂級期刊《Horticulture Research》在線發表了題為“Genomic analysis reveals the genetic diversity, population structure, evolutionary history and relationships of Chinese pepper”的研究論文。該論文系統地研究了花椒和竹葉花椒的遺傳多樣性、品種間的親緣關系及栽培起源，對花椒種質資源的高效利用和保護具有重要意義。
該論文通過GBS簡化基因組測序技術對112份花椒和竹葉花椒種質資源的遺傳多樣性進行分析，鑒定到38,395個SNPs標記。群體結構分析表明，花椒主要分為三個分支，Clade I和Clade II分別位于秦嶺以北和秦嶺以南，而Clade III主要分布于西南地區。竹葉花椒的栽培群體和野生群體各自聚為一個分支，主要分布于西南地區。品種間親緣關系分析表明，花椒在進化過程中發生過多次分化事件，花椒和竹葉花椒之間未發現近期基因滲入現象，然而種內不同品種間卻檢測到基因滲入現象。該研究通過溯祖理論和物種潛在分布區模擬構建了這兩個物種的種群動態歷史，推斷表明，花椒和竹葉花椒的分化時間距今約12 百萬年，氣候變化是花椒和竹葉花椒群體動態歷史形成的主要原因。花椒經歷了長期穩定的種群擴張，其有效群體大小在末次冰川盛期急劇下降。而竹葉花椒的有效群體大小表現出較快的增長趨勢，到末次冰川盛期時增長減慢或停止增長。該研究進一步通過馴化歷史模型分析推斷了花椒的栽培起源，甘肅武都可能是栽培花椒的起源中心。
我校博士后馮世靜，博士畢業研究生劉振山為該論文第一作者，魏安智教授為論文通訊作者。該研究得到了國家重點研發計劃項目（2018YFD1000605）和國家林業和草原局科技發展中心項目（KJZXSA202025）的資助。
論文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41438-020-00376-z
日期：2020-10-16
該論文通過GBS簡化基因組測序技術對112份花椒和竹葉花椒種質資源的遺傳多樣性進行分析，鑒定到38,395個SNPs標記。群體結構分析表明，花椒主要分為三個分支，Clade I和Clade II分別位于秦嶺以北和秦嶺以南，而Clade III主要分布于西南地區。竹葉花椒的栽培群體和野生群體各自聚為一個分支，主要分布于西南地區。品種間親緣關系分析表明，花椒在進化過程中發生過多次分化事件，花椒和竹葉花椒之間未發現近期基因滲入現象，然而種內不同品種間卻檢測到基因滲入現象。該研究通過溯祖理論和物種潛在分布區模擬構建了這兩個物種的種群動態歷史，推斷表明，花椒和竹葉花椒的分化時間距今約12 百萬年，氣候變化是花椒和竹葉花椒群體動態歷史形成的主要原因。花椒經歷了長期穩定的種群擴張，其有效群體大小在末次冰川盛期急劇下降。而竹葉花椒的有效群體大小表現出較快的增長趨勢，到末次冰川盛期時增長減慢或停止增長。該研究進一步通過馴化歷史模型分析推斷了花椒的栽培起源，甘肅武都可能是栽培花椒的起源中心。
我校博士后馮世靜，博士畢業研究生劉振山為該論文第一作者，魏安智教授為論文通訊作者。該研究得到了國家重點研發計劃項目（2018YFD1000605）和國家林業和草原局科技發展中心項目（KJZXSA202025）的資助。
論文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41438-020-00376-z
日期：2020-10-16
