近日，基因中心聯(lián)合南開大學生命科學學院高山副教授等學者在國際著名期刊《Frontiers in Microbiology》（IF=5.640）發(fā)表題為“Full-Length Genome of an Ogataea polymorphaStrain CBS4732 ura3Δ Reveals Large Duplicated Segments in Subtelomeric Regionsteins”的文章（原文鏈接：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.855666/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Microbiology&id=855666）。基因中心貝錦龍副研究員為論文的共同第一作者。
漢遜酵母（Ogataea polymorpha）是產(chǎn)業(yè)化應用最廣泛的生物反應器之一，CBS4732、NCYC495與DL-1是三種應用最普遍與研究最多的漢遜酵母菌株。基于CBS4732營養(yǎng)缺陷型菌株，南開大學汪和睦教授曾開發(fā)了第一個全國產(chǎn)化的乙肝疫苗，但由于長期以來缺乏高質(zhì)量的全基因組數(shù)據(jù)，學界對三者之間的進化關(guān)系存在很大爭議。
基因中心微生物資源室副主任貝錦龍博士長期深耕于甲醇酵母產(chǎn)業(yè)化應用領(lǐng)域，近年與南開大學合作，通過對營養(yǎng)缺陷型CBS4732 ura3Δ菌株的高通量深度測序，得到了含有準確端粒信息的完整全長基因組。鑒定發(fā)現(xiàn)，CBS4732與NCYC495菌株同屬一個種，且系統(tǒng)發(fā)育非常接近，因此基于兩種菌株的基礎(chǔ)研究成果和已開發(fā)產(chǎn)品可以完全合并。這為進一步深化漢遜酵母產(chǎn)業(yè)化應用，提供了堅實的理論基礎(chǔ)，同時，也在國際上首次報道了酵母亞端粒區(qū)存在長度達2.7萬bp以上的接近100%同一度的重復大片段。此前，“亞端粒區(qū)大片段擴增是酵母基因組擴張主因”這一科學假說存在較大爭議，本發(fā)現(xiàn)為證實該假說的真實性提供了證據(jù)。
日期：2022-04-24
漢遜酵母（Ogataea polymorpha）是產(chǎn)業(yè)化應用最廣泛的生物反應器之一，CBS4732、NCYC495與DL-1是三種應用最普遍與研究最多的漢遜酵母菌株。基于CBS4732營養(yǎng)缺陷型菌株，南開大學汪和睦教授曾開發(fā)了第一個全國產(chǎn)化的乙肝疫苗，但由于長期以來缺乏高質(zhì)量的全基因組數(shù)據(jù)，學界對三者之間的進化關(guān)系存在很大爭議。
基因中心微生物資源室副主任貝錦龍博士長期深耕于甲醇酵母產(chǎn)業(yè)化應用領(lǐng)域，近年與南開大學合作，通過對營養(yǎng)缺陷型CBS4732 ura3Δ菌株的高通量深度測序，得到了含有準確端粒信息的完整全長基因組。鑒定發(fā)現(xiàn)，CBS4732與NCYC495菌株同屬一個種，且系統(tǒng)發(fā)育非常接近，因此基于兩種菌株的基礎(chǔ)研究成果和已開發(fā)產(chǎn)品可以完全合并。這為進一步深化漢遜酵母產(chǎn)業(yè)化應用，提供了堅實的理論基礎(chǔ)，同時，也在國際上首次報道了酵母亞端粒區(qū)存在長度達2.7萬bp以上的接近100%同一度的重復大片段。此前，“亞端粒區(qū)大片段擴增是酵母基因組擴張主因”這一科學假說存在較大爭議，本發(fā)現(xiàn)為證實該假說的真實性提供了證據(jù)。
日期：2022-04-24
